Filmen tar vid efter den slutgiltiga striden 2017 mellan apor och människor. Fler apsamhällen har vuxit fram sedan Caesar tog sitt folk till en plats där de kunde leva ifred. Nu är det människorna som befinner sig i utkanten och är halvt förvildade. En del apgrupper har aldrig hört talas om Caesar medan andra fortfarande vördar hans arv och försöker följa i hans fotspår. En apledare börjar förslava andra apstammar i sin jakt på människoteknik. En apa som får se sin stam besegras bestämmer sig för att leta efter friheten. En ung människokvinna visar sig bli nyckeln till människotekniken men har i det tysta andra planer.